Der zumeist deutschsprachige Bestand umfasst über 30.000 Bände sowie 1.325 Periodika, davon 350 laufend gehaltene Zeitschriften. Neben den zahlreichen Ortsmonografien zu den von Deutschen bewohnten Orten in Südost- und Osteuropa ist besonders auf die nach 1945 zahlreich erschienenen Heimatbriefe und -blätter hinzuweisen. Mehr als 800 dieser Titel werden im Freiburger Zeitschriftennachweis nur durch die Institutsbibliothek gemeldet. Eine Vollständigkeit wird durch laufende Neuerwerbungen angestrebt.

Als Präsenzbibliothek kann der Bestand nur in den Räumlichkeiten der Bibliothek genutzt werden. Wegen des landesübergreifenden Charakters wird die Bibliothek von in- und ausländischen Gästen besucht. Die Präsenzregelung soll sicherstellen, dass jeder Benutzer die Bücher vor Ort einsehen kann. Eine Ausleihe findet nur in Ausnahmefällen (z. B. Wochenendausleihe für Studierende) statt.

Den Nutzern stehen mehrere Arbeitsplätze sowie technische Geräte (Fotokopierer, Lesegeräte für Mikrofiche und -filme, Plattenspieler, Tonbandgerät usw.) zur Verfügung. Die Bestandserschließung der Bibliothek erfolgt durch alphabetische und systematische Karten- sowie Online-Kataloge. Der Zeitschriftenbestand ist vollständig im Online-Katalog der Universitätsbibliothek Freiburg nachgewiesen. Der Buchbestand ist vollständig im Katalog des Südwestdeutschen Bibliotheksverbundes erfasst.

Der Bibliotheksbestand kann vollständig recherchiert werden unter: http://swb.bsz-bw.de/DB=2.377